Kayseri Gümrük Müdürlüğü, A sınıfı Gümrük Müdürlüğü statüsüyle her türlü ithalat, ihracat, transit ve yolcu işlemlerini yapmaya yetkili olmakla birlikte, ihtisas gümrüklerinin yetkisinde bulunan tekstil ürünleri, kullanılmış alet ve makine, bitki ve bitkisel ürün, cam eşya, düzcü ve AB menşeli olmayan mobilya ithal işlemlerinde de yetkili Gümrük Müdürlüğüdür.

 
Kayseri Gümrük Müdürlüğü, TS EN ISO 9001:2008 (Gümrük Hizmetleri Sunumu) Kalite Yönetim Sistemi Belgesine sahiptir.